Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
MSLNQ13421 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
MSLNQ13421 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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