Protein–RNA interactions for Protein: Q12864

CDH17, Cadherin-17, humanhuman

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Length 832 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH17Q12864 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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CDH17Q12864 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CDH17Q12864 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
CDH17Q12864 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CDH17Q12864 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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