Protein–RNA interactions for Protein: P55058

PLTP, Phospholipid transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLTPP55058 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PLTPP55058 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLTPP55058 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLTPP55058 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLTPP55058 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLTPP55058 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLTPP55058 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLTPP55058 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PLTPP55058 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PLTPP55058 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
PLTPP55058 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms