Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
AP2S1P53680 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms