Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
THBS4P35443 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THBS4P35443 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THBS4P35443 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THBS4P35443 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THBS4P35443 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
THBS4P35443 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
THBS4P35443 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
THBS4P35443 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms