Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
AMY2BP19961 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107 ms