Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
HLA-DOBP13765 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HLA-DOBP13765 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms