Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ89

DUX4L6, Double homeobox protein 4-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L6P0CJ89 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
DUX4L6P0CJ89 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms