Protein–RNA interactions for Protein: P09016

HOXD4, Homeobox protein Hox-D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD4P09016 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
HOXD4P09016 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms