Protein–RNA interactions for Protein: O60279

SUSD5, Sushi domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 629 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD5O60279 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SUSD5O60279 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms