Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
FANCAO15360 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCAO15360 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCAO15360 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCAO15360 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCAO15360 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCAO15360 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCAO15360 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FANCAO15360 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FANCAO15360 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
FANCAO15360 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FANCAO15360 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
FANCAO15360 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms