Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
HMGB1P1B2RPK0 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms