Protein–RNA interactions for Protein: A7MD48

SRRM4, Serine/arginine repetitive matrix protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM4A7MD48 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SRRM4A7MD48 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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