Protein–RNA interactions for Protein: A6NI79

CCDC69, Coiled-coil domain-containing protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC69A6NI79 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CCDC69A6NI79 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CCDC69A6NI79 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms