Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYE9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0J9YYE9 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
A0A0J9YYE9 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms