Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6S5

IGKV1-27, Immunoglobulin kappa variable 1-27, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-27A0A075B6S5 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
IGKV1-27A0A075B6S5 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
IGKV1-27A0A075B6S5 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms