Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQP3

TNN, Tenascin-N, humanhuman

Predictions only

Length 1,299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNQ9UQP3 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
TNNQ9UQP3 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TNNQ9UQP3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms