Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CT45A11P-201ENST00000448043 1134 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC140125.3-202ENST00000504362 348 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC138965.1-201ENST00000509329 348 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PGPEP1Q9NXJ5 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
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PGPEP1Q9NXJ5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SPATA4-201ENST00000280191 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 AL355870.1-201ENST00000448272 454 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
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