Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRP2

CMC2, COX assembly mitochondrial protein 2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC2Q9NRP2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CMC2Q9NRP2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms