Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ARFGAP3Q9NP61 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ARFGAP3Q9NP61 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms