Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7Z3

NRDE2, Protein NRDE2 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRDE2Q9H7Z3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
NRDE2Q9H7Z3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms