Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HDAC8Q9BY41 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HDAC8Q9BY41 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms