Protein–RNA interactions for Protein: Q99956

DUSP9, Dual specificity protein phosphatase 9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP9Q99956 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
DUSP9Q99956 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DUSP9Q99956 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms