Protein–RNA interactions for Protein: Q99570

PIK3R4, Phosphoinositide 3-kinase regulatory subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3R4Q99570 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PIK3R4Q99570 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms