Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
KLHL15Q96M94 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
KLHL15Q96M94 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms