Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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FAM3DQ96BQ1 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
FAM3DQ96BQ1 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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