Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 ATP11A-205ENST00000419448 435 ntTSL 37.84□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 39
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TBRG4Q969Z0 RELN-202ENST00000424685 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 38.9
TBRG4Q969Z0 RELN-203ENST00000428762 11571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.573e-6■■■■■ 38.9
TBRG4Q969Z0 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 38.9
TBRG4Q969Z0 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.122e-6■■■■■ 38.9
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TBRG4Q969Z0 CSE1L-202ENST00000396192 3459 ntTSL 5 BASIC11.01□□□□□ -0.651e-6■■■■■ 38.8
TBRG4Q969Z0 TNS1-206ENST00000423413 548 ntTSL 310.9□□□□□ -0.662e-7■■■■■ 38.8
TBRG4Q969Z0 GREB1-203ENST00000381483 2347 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.782e-7■■■■■ 38.8
TBRG4Q969Z0 TNS1-211ENST00000449814 582 ntTSL 36.27□□□□□ -1.412e-7■■■■■ 38.8
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TBRG4Q969Z0 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.428e-72■■■■■ 38.7
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TBRG4Q969Z0 LPP-201ENST00000414139 502 ntTSL 46.72□□□□□ -1.331e-6■■■■■ 38.7
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TBRG4Q969Z0 ABCF1-203ENST00000441867 1074 ntTSL 58.88□□□□□ -0.993e-7■■■■■ 38.6
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TBRG4Q969Z0 CFL1-207ENST00000527752 766 ntTSL 511.28□□□□□ -0.67e-8■■■■■ 38.6
TBRG4Q969Z0 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.46e-7■■■■■ 38.6
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TBRG4Q969Z0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.941e-7■■■■■ 38.4
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TBRG4Q969Z0 SEPT5-205ENST00000412544 1108 ntTSL 514.83□□□□□ -0.041e-7■■■■■ 38.4
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TBRG4Q969Z0 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.615e-7■■■■■ 38.4
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TBRG4Q969Z0 HNRNPC-217ENST00000555176 531 ntTSL 53.43□□□□□ -1.861e-8■■■■■ 38.4
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TBRG4Q969Z0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.921e-11■■■■■ 38.3
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TBRG4Q969Z0 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.243e-7■■■■■ 38.2
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TBRG4Q969Z0 PTPRN2-203ENST00000389418 4706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 38.1
TBRG4Q969Z0 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.22e-6■■■■■ 38.1
TBRG4Q969Z0 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 38
TBRG4Q969Z0 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.372e-6■■■■■ 38
TBRG4Q969Z0 LRMDA-201ENST00000372499 899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.992e-6■■■■■ 38
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TBRG4Q969Z0 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.141e-8■■■■■ 38
TBRG4Q969Z0 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.141e-8■■■■■ 38
TBRG4Q969Z0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.851e-8■■■■■ 38
TBRG4Q969Z0 GOLPH3-202ENST00000503610 1074 ntTSL 330.99■■■□□ 2.553e-9■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 GOLPH3-203ENST00000512668 665 ntTSL 322.92■■□□□ 1.263e-9■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.882e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.613e-9■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.39e-8■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.273e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 MBNL1-207ENST00000459747 594 ntTSL 415.15■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.082e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.269e-8■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 SMAD3-204ENST00000540846 1567 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 SMAD3-202ENST00000439724 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.73□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 TIAM2-208ENST00000461783 6981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.6□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-201ENST00000256830 2920 ntTSL 5 BASIC9.34□□□□□ -0.912e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-209ENST00000456986 8436 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 NEDD4L-204ENST00000382850 8251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 MBNL1-221ENST00000495875 545 ntTSL 28.05□□□□□ -1.122e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 TIAM2-213ENST00000535064 768 ntTSL 56.15□□□□□ -1.422e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 SMAD3-209ENST00000558894 797 ntTSL 55.33□□□□□ -1.562e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 SHANK2-218ENST00000601538 9062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.32e-6■■■■■ 37.9
TBRG4Q969Z0 MTND2P28-201ENST00000457540 1044 ntBASIC4.41□□□□□ -1.72e-66■■■■■ 37.8
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