Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
NKD1Q969G9 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms