Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
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GTF3C6Q969F1 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF3C6Q969F1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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GTF3C6Q969F1 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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GTF3C6Q969F1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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GTF3C6Q969F1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
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GTF3C6Q969F1 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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GTF3C6Q969F1 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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GTF3C6Q969F1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF3C6Q969F1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
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