Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
ATG16L1Q676U5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
ATG16L1Q676U5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms