Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGJ6

HDGFL1, Hepatoma-derived growth factor-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL1Q5TGJ6 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HDGFL1Q5TGJ6 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms