Protein–RNA interactions for Protein: Q5JTW2

CEP78, Centrosomal protein of 78 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP78Q5JTW2 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CEP78Q5JTW2 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms