Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL12Q53G59 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms