Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2E3

ODF4, Outer dense fiber protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF4Q2M2E3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ODF4Q2M2E3 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms