Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CDKN3Q16667 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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