Protein–RNA interactions for Protein: Q16048

PMCHL1, Putative pro-MCH-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL1Q16048 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
PMCHL1Q16048 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms