Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
GPNMBQ14956 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
GPNMBQ14956 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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