Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

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Length 182 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
CBFBQ13951 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
CBFBQ13951 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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