Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
CAPSQ13938 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CAPSQ13938 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms