Protein–RNA interactions for Protein: Q13733

ATP1A4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP1A4Q13733 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ATP1A4Q13733 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
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