Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
PDE4DQ08499 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms