Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SLC3A1Q07837 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms