Protein–RNA interactions for Protein: P59666

DEFA3, Neutrophil defensin 3, humanhuman

Predictions only

Length 94 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA3P59666 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DEFA3P59666 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DEFA3P59666 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.6 ms