Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
NLRP12P59046 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
NLRP12P59046 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms