Protein–RNA interactions for Protein: P51148

RAB5C, Ras-related protein Rab-5C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5CP51148 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
RAB5CP51148 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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