Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CASP4P49662 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CASP4P49662 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CASP4P49662 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CASP4P49662 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CASP4P49662 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms