Protein–RNA interactions for Protein: P49335

POU3F4, POU domain, class 3, transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU3F4P49335 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
POU3F4P49335 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.4 ms