Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARGP37231 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
PPARGP37231 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PPARGP37231 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PPARGP37231 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PPARGP37231 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms