Protein–RNA interactions for Protein: P32455

GBP1, Guanylate-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 592 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP1P32455 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GBP1P32455 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GBP1P32455 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBP1P32455 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBP1P32455 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBP1P32455 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBP1P32455 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBP1P32455 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBP1P32455 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBP1P32455 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBP1P32455 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
GBP1P32455 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBP1P32455 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GBP1P32455 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GBP1P32455 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
GBP1P32455 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms