Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HOXA10P31260 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
HOXA10P31260 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms